Le projet respecte l’équilibre actuel entre les bâtiments existants, leurs volumes, et le jardin qui les entoure en s’inscrivant le plus discrètement possible dans cet environnement sensible. L’installation du nouveau bâtiment devient prétexte à compléter les parcours du parc en offrant une esplanade et en bouclant le cheminement paysager autour du Musée. Il gère du même coup la transition entre le Musée et les immeubles situés au nord de la parcelle.
Clair et accueillant, l’espace d’entrée du Musée est agrandi et conçu comme une vitrine qui se montre à la ville. Le déménagement des logements des scientifiques permet de libérer l’espace pour accueillir la boutique, le réfectoire privé et l’aula, le long de la route de Malagnon. Le lien avec la ville est ainsi renforcé.